Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBGCP4Q9UGJ1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBGCP4Q9UGJ1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBGCP4Q9UGJ1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBGCP4Q9UGJ1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBGCP4Q9UGJ1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBGCP4Q9UGJ1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBGCP4Q9UGJ1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBGCP4Q9UGJ1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBGCP4Q9UGJ1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBGCP4Q9UGJ1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBGCP4Q9UGJ1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP4Q9UGJ1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP4Q9UGJ1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP4Q9UGJ1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP4Q9UGJ1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP4Q9UGJ1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP4Q9UGJ1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP4Q9UGJ1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBGCP4Q9UGJ1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBGCP4Q9UGJ1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TUBGCP4Q9UGJ1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBGCP4Q9UGJ1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBGCP4Q9UGJ1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBGCP4Q9UGJ1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms