Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CFDP1Q9UEE9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CFDP1Q9UEE9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CFDP1Q9UEE9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CFDP1Q9UEE9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CFDP1Q9UEE9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CFDP1Q9UEE9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CFDP1Q9UEE9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CFDP1Q9UEE9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CFDP1Q9UEE9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CFDP1Q9UEE9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CFDP1Q9UEE9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CFDP1Q9UEE9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CFDP1Q9UEE9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CFDP1Q9UEE9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CFDP1Q9UEE9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CFDP1Q9UEE9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CFDP1Q9UEE9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CFDP1Q9UEE9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CFDP1Q9UEE9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CFDP1Q9UEE9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
CFDP1Q9UEE9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CFDP1Q9UEE9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CFDP1Q9UEE9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CFDP1Q9UEE9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC37■■■■□ 3.51
CFDP1Q9UEE9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
CFDP1Q9UEE9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC37■■■■□ 3.51
CFDP1Q9UEE9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CFDP1Q9UEE9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CFDP1Q9UEE9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CFDP1Q9UEE9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
CFDP1Q9UEE9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CFDP1Q9UEE9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CFDP1Q9UEE9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
CFDP1Q9UEE9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CFDP1Q9UEE9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
CFDP1Q9UEE9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CFDP1Q9UEE9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CFDP1Q9UEE9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CFDP1Q9UEE9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CFDP1Q9UEE9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CFDP1Q9UEE9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CFDP1Q9UEE9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CFDP1Q9UEE9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CFDP1Q9UEE9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CFDP1Q9UEE9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CFDP1Q9UEE9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CFDP1Q9UEE9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
CFDP1Q9UEE9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CFDP1Q9UEE9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CFDP1Q9UEE9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CFDP1Q9UEE9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CFDP1Q9UEE9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CFDP1Q9UEE9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CFDP1Q9UEE9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CFDP1Q9UEE9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CFDP1Q9UEE9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CFDP1Q9UEE9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CFDP1Q9UEE9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CFDP1Q9UEE9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CFDP1Q9UEE9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CFDP1Q9UEE9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CFDP1Q9UEE9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CFDP1Q9UEE9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CFDP1Q9UEE9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CFDP1Q9UEE9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
CFDP1Q9UEE9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
CFDP1Q9UEE9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
CFDP1Q9UEE9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CFDP1Q9UEE9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms