Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN8Q9UBY8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLN8Q9UBY8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLN8Q9UBY8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms