Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBJ2

ABCD2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD2Q9UBJ2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCD2Q9UBJ2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCD2Q9UBJ2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCD2Q9UBJ2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms