Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C6orf48Q9UBA6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C6orf48Q9UBA6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms