Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SUCLA2Q9P2R7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SUCLA2Q9P2R7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SUCLA2Q9P2R7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SUCLA2Q9P2R7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SUCLA2Q9P2R7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SUCLA2Q9P2R7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SUCLA2Q9P2R7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SUCLA2Q9P2R7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SUCLA2Q9P2R7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SUCLA2Q9P2R7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SUCLA2Q9P2R7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SUCLA2Q9P2R7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SUCLA2Q9P2R7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SUCLA2Q9P2R7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUCLA2Q9P2R7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUCLA2Q9P2R7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUCLA2Q9P2R7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUCLA2Q9P2R7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUCLA2Q9P2R7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUCLA2Q9P2R7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUCLA2Q9P2R7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUCLA2Q9P2R7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SUCLA2Q9P2R7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUCLA2Q9P2R7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SUCLA2Q9P2R7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUCLA2Q9P2R7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUCLA2Q9P2R7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SUCLA2Q9P2R7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUCLA2Q9P2R7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms