Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL13Q9P2N7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL13Q9P2N7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms