Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ARHGAP28Q9P2N2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGAP28Q9P2N2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARHGAP28Q9P2N2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARHGAP28Q9P2N2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms