Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCNT4Q9P109 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCNT4Q9P109 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCNT4Q9P109 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCNT4Q9P109 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCNT4Q9P109 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCNT4Q9P109 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCNT4Q9P109 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCNT4Q9P109 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCNT4Q9P109 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.76
GCNT4Q9P109 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GCNT4Q9P109 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GCNT4Q9P109 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GCNT4Q9P109 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GCNT4Q9P109 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GCNT4Q9P109 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GCNT4Q9P109 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCNT4Q9P109 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCNT4Q9P109 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCNT4Q9P109 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCNT4Q9P109 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCNT4Q9P109 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GCNT4Q9P109 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCNT4Q9P109 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCNT4Q9P109 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCNT4Q9P109 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCNT4Q9P109 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCNT4Q9P109 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCNT4Q9P109 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCNT4Q9P109 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCNT4Q9P109 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCNT4Q9P109 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCNT4Q9P109 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCNT4Q9P109 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms