Protein–RNA interactions for Protein: Q9P013

CWC15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC15Q9P013 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CWC15Q9P013 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CWC15Q9P013 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CWC15Q9P013 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CWC15Q9P013 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CWC15Q9P013 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CWC15Q9P013 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CWC15Q9P013 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CWC15Q9P013 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CWC15Q9P013 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CWC15Q9P013 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CWC15Q9P013 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CWC15Q9P013 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CWC15Q9P013 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CWC15Q9P013 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CWC15Q9P013 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CWC15Q9P013 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CWC15Q9P013 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CWC15Q9P013 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CWC15Q9P013 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CWC15Q9P013 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CWC15Q9P013 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CWC15Q9P013 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC15Q9P013 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms