Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMCD1Q9NZU5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LMCD1Q9NZU5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LMCD1Q9NZU5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMCD1Q9NZU5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms