Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU0

FLRT3, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT3, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLRT3Q9NZU0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FLRT3Q9NZU0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FLRT3Q9NZU0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FLRT3Q9NZU0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLRT3Q9NZU0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLRT3Q9NZU0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLRT3Q9NZU0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLRT3Q9NZU0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLRT3Q9NZU0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLRT3Q9NZU0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLRT3Q9NZU0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLRT3Q9NZU0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLRT3Q9NZU0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLRT3Q9NZU0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLRT3Q9NZU0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms