Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ARHGEF12Q9NZN5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ARHGEF12Q9NZN5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ARHGEF12Q9NZN5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ARHGEF12Q9NZN5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
ARHGEF12Q9NZN5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ARHGEF12Q9NZN5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ARHGEF12Q9NZN5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ARHGEF12Q9NZN5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ARHGEF12Q9NZN5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ARHGEF12Q9NZN5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ARHGEF12Q9NZN5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ARHGEF12Q9NZN5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
ARHGEF12Q9NZN5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ARHGEF12Q9NZN5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ARHGEF12Q9NZN5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ARHGEF12Q9NZN5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ARHGEF12Q9NZN5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ARHGEF12Q9NZN5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ARHGEF12Q9NZN5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ARHGEF12Q9NZN5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ARHGEF12Q9NZN5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ARHGEF12Q9NZN5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ARHGEF12Q9NZN5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
ARHGEF12Q9NZN5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
ARHGEF12Q9NZN5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ARHGEF12Q9NZN5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ARHGEF12Q9NZN5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ARHGEF12Q9NZN5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ARHGEF12Q9NZN5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ARHGEF12Q9NZN5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ARHGEF12Q9NZN5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ARHGEF12Q9NZN5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ARHGEF12Q9NZN5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ARHGEF12Q9NZN5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ARHGEF12Q9NZN5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ARHGEF12Q9NZN5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ARHGEF12Q9NZN5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ARHGEF12Q9NZN5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ARHGEF12Q9NZN5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ARHGEF12Q9NZN5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ARHGEF12Q9NZN5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ARHGEF12Q9NZN5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ARHGEF12Q9NZN5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ARHGEF12Q9NZN5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
ARHGEF12Q9NZN5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
ARHGEF12Q9NZN5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ARHGEF12Q9NZN5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ARHGEF12Q9NZN5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ARHGEF12Q9NZN5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ARHGEF12Q9NZN5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ARHGEF12Q9NZN5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
ARHGEF12Q9NZN5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
ARHGEF12Q9NZN5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ARHGEF12Q9NZN5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
ARHGEF12Q9NZN5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
ARHGEF12Q9NZN5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ARHGEF12Q9NZN5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC36.72■■■■□ 3.47
ARHGEF12Q9NZN5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
ARHGEF12Q9NZN5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
ARHGEF12Q9NZN5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ARHGEF12Q9NZN5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ARHGEF12Q9NZN5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ARHGEF12Q9NZN5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ARHGEF12Q9NZN5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ARHGEF12Q9NZN5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
ARHGEF12Q9NZN5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ARHGEF12Q9NZN5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ARHGEF12Q9NZN5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ARHGEF12Q9NZN5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ARHGEF12Q9NZN5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
ARHGEF12Q9NZN5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
ARHGEF12Q9NZN5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ARHGEF12Q9NZN5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ARHGEF12Q9NZN5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ARHGEF12Q9NZN5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ARHGEF12Q9NZN5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ARHGEF12Q9NZN5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ARHGEF12Q9NZN5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ARHGEF12Q9NZN5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
ARHGEF12Q9NZN5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ARHGEF12Q9NZN5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ARHGEF12Q9NZN5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ARHGEF12Q9NZN5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ARHGEF12Q9NZN5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ARHGEF12Q9NZN5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ARHGEF12Q9NZN5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
ARHGEF12Q9NZN5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ARHGEF12Q9NZN5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ARHGEF12Q9NZN5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
ARHGEF12Q9NZN5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ARHGEF12Q9NZN5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms