Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBP1Q9NZI7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBP1Q9NZI7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBP1Q9NZI7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UBP1Q9NZI7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBP1Q9NZI7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBP1Q9NZI7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UBP1Q9NZI7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBP1Q9NZI7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBP1Q9NZI7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBP1Q9NZI7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBP1Q9NZI7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBP1Q9NZI7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBP1Q9NZI7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBP1Q9NZI7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBP1Q9NZI7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBP1Q9NZI7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBP1Q9NZI7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBP1Q9NZI7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBP1Q9NZI7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBP1Q9NZI7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBP1Q9NZI7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBP1Q9NZI7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBP1Q9NZI7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBP1Q9NZI7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBP1Q9NZI7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBP1Q9NZI7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBP1Q9NZI7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBP1Q9NZI7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBP1Q9NZI7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBP1Q9NZI7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
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