Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDND1Q9NY35 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDND1Q9NY35 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLDND1Q9NY35 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDND1Q9NY35 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDND1Q9NY35 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms