Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GIN1Q9NXP7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIN1Q9NXP7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIN1Q9NXP7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms