Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PGPEP1Q9NXJ5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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