Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKS1Q9NXB0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MKS1Q9NXB0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms