Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH2

TMEM242, Transmembrane protein 242, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM242Q9NWH2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM242Q9NWH2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM242Q9NWH2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM242Q9NWH2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM242Q9NWH2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM242Q9NWH2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM242Q9NWH2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms