Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBCCD1Q9NVR7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBCCD1Q9NVR7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBCCD1Q9NVR7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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