Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD4Q9NVD3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD4Q9NVD3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD4Q9NVD3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD4Q9NVD3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD4Q9NVD3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD4Q9NVD3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD4Q9NVD3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD4Q9NVD3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD4Q9NVD3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD4Q9NVD3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD4Q9NVD3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD4Q9NVD3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD4Q9NVD3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD4Q9NVD3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD4Q9NVD3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD4Q9NVD3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD4Q9NVD3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD4Q9NVD3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD4Q9NVD3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD4Q9NVD3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD4Q9NVD3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD4Q9NVD3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD4Q9NVD3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD4Q9NVD3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD4Q9NVD3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD4Q9NVD3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD4Q9NVD3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD4Q9NVD3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD4Q9NVD3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD4Q9NVD3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD4Q9NVD3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD4Q9NVD3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD4Q9NVD3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD4Q9NVD3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD4Q9NVD3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD4Q9NVD3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SETD4Q9NVD3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SETD4Q9NVD3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SETD4Q9NVD3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD4Q9NVD3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD4Q9NVD3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SETD4Q9NVD3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SETD4Q9NVD3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SETD4Q9NVD3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms