Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IMP3Q9NV31 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMP3Q9NV31 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms