Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM140Q9NV12 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TMEM140Q9NV12 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TMEM140Q9NV12 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TMEM140Q9NV12 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM140Q9NV12 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms