Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
DCAF13Q9NV06 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF13Q9NV06 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF13Q9NV06 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms