Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMBRD1Q9NUN5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LMBRD1Q9NUN5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LMBRD1Q9NUN5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms