Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC39A9Q9NUM3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC39A9Q9NUM3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC39A9Q9NUM3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms