Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTN9

SEMA4G, Semaphorin-4G, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4GQ9NTN9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEMA4GQ9NTN9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4GQ9NTN9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms