Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
LTBP3Q9NS15 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LTBP3Q9NS15 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LTBP3Q9NS15 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LTBP3Q9NS15 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
LTBP3Q9NS15 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
LTBP3Q9NS15 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
LTBP3Q9NS15 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
LTBP3Q9NS15 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LTBP3Q9NS15 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LTBP3Q9NS15 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
LTBP3Q9NS15 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
LTBP3Q9NS15 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LTBP3Q9NS15 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LTBP3Q9NS15 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LTBP3Q9NS15 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LTBP3Q9NS15 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP3Q9NS15 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP3Q9NS15 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP3Q9NS15 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP3Q9NS15 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBP3Q9NS15 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTBP3Q9NS15 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTBP3Q9NS15 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTBP3Q9NS15 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
LTBP3Q9NS15 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTBP3Q9NS15 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTBP3Q9NS15 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTBP3Q9NS15 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LTBP3Q9NS15 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LTBP3Q9NS15 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LTBP3Q9NS15 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LTBP3Q9NS15 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LTBP3Q9NS15 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LTBP3Q9NS15 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LTBP3Q9NS15 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTBP3Q9NS15 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
LTBP3Q9NS15 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTBP3Q9NS15 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTBP3Q9NS15 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTBP3Q9NS15 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LTBP3Q9NS15 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LTBP3Q9NS15 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LTBP3Q9NS15 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LTBP3Q9NS15 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LTBP3Q9NS15 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LTBP3Q9NS15 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
LTBP3Q9NS15 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
LTBP3Q9NS15 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LTBP3Q9NS15 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LTBP3Q9NS15 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LTBP3Q9NS15 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LTBP3Q9NS15 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LTBP3Q9NS15 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LTBP3Q9NS15 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LTBP3Q9NS15 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LTBP3Q9NS15 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LTBP3Q9NS15 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
LTBP3Q9NS15 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LTBP3Q9NS15 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LTBP3Q9NS15 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LTBP3Q9NS15 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LTBP3Q9NS15 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LTBP3Q9NS15 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LTBP3Q9NS15 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LTBP3Q9NS15 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LTBP3Q9NS15 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LTBP3Q9NS15 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTBP3Q9NS15 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTBP3Q9NS15 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTBP3Q9NS15 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTBP3Q9NS15 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTBP3Q9NS15 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LTBP3Q9NS15 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
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