Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX6

TMEM167B, Protein kish-B, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM167BQ9NRX6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM167BQ9NRX6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM167BQ9NRX6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM167BQ9NRX6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM167BQ9NRX6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM167BQ9NRX6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM167BQ9NRX6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM167BQ9NRX6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM167BQ9NRX6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM167BQ9NRX6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM167BQ9NRX6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM167BQ9NRX6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM167BQ9NRX6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM167BQ9NRX6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM167BQ9NRX6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM167BQ9NRX6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM167BQ9NRX6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM167BQ9NRX6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM167BQ9NRX6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms