Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMPRSS4Q9NRS4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMPRSS4Q9NRS4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms