Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SEC31BQ9NQW1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SEC31BQ9NQW1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SEC31BQ9NQW1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SEC31BQ9NQW1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SEC31BQ9NQW1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SEC31BQ9NQW1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SEC31BQ9NQW1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SEC31BQ9NQW1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SEC31BQ9NQW1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SEC31BQ9NQW1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SEC31BQ9NQW1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SEC31BQ9NQW1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SEC31BQ9NQW1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SEC31BQ9NQW1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SEC31BQ9NQW1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SEC31BQ9NQW1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SEC31BQ9NQW1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SEC31BQ9NQW1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SEC31BQ9NQW1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SEC31BQ9NQW1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SEC31BQ9NQW1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SEC31BQ9NQW1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SEC31BQ9NQW1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SEC31BQ9NQW1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SEC31BQ9NQW1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SEC31BQ9NQW1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SEC31BQ9NQW1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SEC31BQ9NQW1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SEC31BQ9NQW1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SEC31BQ9NQW1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SEC31BQ9NQW1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SEC31BQ9NQW1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SEC31BQ9NQW1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SEC31BQ9NQW1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SEC31BQ9NQW1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SEC31BQ9NQW1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SEC31BQ9NQW1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SEC31BQ9NQW1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SEC31BQ9NQW1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SEC31BQ9NQW1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SEC31BQ9NQW1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SEC31BQ9NQW1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SEC31BQ9NQW1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SEC31BQ9NQW1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SEC31BQ9NQW1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SEC31BQ9NQW1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SEC31BQ9NQW1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SEC31BQ9NQW1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SEC31BQ9NQW1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SEC31BQ9NQW1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SEC31BQ9NQW1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SEC31BQ9NQW1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SEC31BQ9NQW1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SEC31BQ9NQW1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SEC31BQ9NQW1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SEC31BQ9NQW1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SEC31BQ9NQW1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SEC31BQ9NQW1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SEC31BQ9NQW1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SEC31BQ9NQW1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SEC31BQ9NQW1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SEC31BQ9NQW1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SEC31BQ9NQW1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SEC31BQ9NQW1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SEC31BQ9NQW1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SEC31BQ9NQW1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SEC31BQ9NQW1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SEC31BQ9NQW1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SEC31BQ9NQW1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SEC31BQ9NQW1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SEC31BQ9NQW1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SEC31BQ9NQW1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SEC31BQ9NQW1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SEC31BQ9NQW1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SEC31BQ9NQW1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms