Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECTIN3Q9NQS3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN3Q9NQS3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN3Q9NQS3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms