Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ1

MKKS, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKKSQ9NPJ1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MKKSQ9NPJ1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MKKSQ9NPJ1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKKSQ9NPJ1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKKSQ9NPJ1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKKSQ9NPJ1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKKSQ9NPJ1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKKSQ9NPJ1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKKSQ9NPJ1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKKSQ9NPJ1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKKSQ9NPJ1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKKSQ9NPJ1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKKSQ9NPJ1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKKSQ9NPJ1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKKSQ9NPJ1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKKSQ9NPJ1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MKKSQ9NPJ1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKKSQ9NPJ1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKKSQ9NPJ1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKKSQ9NPJ1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKKSQ9NPJ1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKKSQ9NPJ1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MKKSQ9NPJ1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKKSQ9NPJ1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKKSQ9NPJ1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKKSQ9NPJ1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKKSQ9NPJ1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms