Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA2

MMP25, Matrix metalloproteinase-25, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP25Q9NPA2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP25Q9NPA2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP25Q9NPA2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP25Q9NPA2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP25Q9NPA2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP25Q9NPA2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP25Q9NPA2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP25Q9NPA2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP25Q9NPA2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP25Q9NPA2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP25Q9NPA2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP25Q9NPA2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP25Q9NPA2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP25Q9NPA2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP25Q9NPA2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP25Q9NPA2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP25Q9NPA2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP25Q9NPA2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP25Q9NPA2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP25Q9NPA2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms