Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA1

KCNMB3, Calcium-activated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB3Q9NPA1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNMB3Q9NPA1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNMB3Q9NPA1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
KCNMB3Q9NPA1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNMB3Q9NPA1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNMB3Q9NPA1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNMB3Q9NPA1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNMB3Q9NPA1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNMB3Q9NPA1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNMB3Q9NPA1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNMB3Q9NPA1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNMB3Q9NPA1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNMB3Q9NPA1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNMB3Q9NPA1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNMB3Q9NPA1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNMB3Q9NPA1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNMB3Q9NPA1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNMB3Q9NPA1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNMB3Q9NPA1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNMB3Q9NPA1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNMB3Q9NPA1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNMB3Q9NPA1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNMB3Q9NPA1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNMB3Q9NPA1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNMB3Q9NPA1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNMB3Q9NPA1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.2 ms