Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRMS1Q9HCU9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRMS1Q9HCU9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRMS1Q9HCU9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRMS1Q9HCU9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRMS1Q9HCU9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRMS1Q9HCU9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRMS1Q9HCU9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRMS1Q9HCU9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRMS1Q9HCU9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRMS1Q9HCU9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRMS1Q9HCU9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRMS1Q9HCU9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BRMS1Q9HCU9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRMS1Q9HCU9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRMS1Q9HCU9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRMS1Q9HCU9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRMS1Q9HCU9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BRMS1Q9HCU9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRMS1Q9HCU9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRMS1Q9HCU9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRMS1Q9HCU9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRMS1Q9HCU9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRMS1Q9HCU9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRMS1Q9HCU9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRMS1Q9HCU9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRMS1Q9HCU9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRMS1Q9HCU9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRMS1Q9HCU9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.53■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BRMS1Q9HCU9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms