Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD248Q9HCU0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD248Q9HCU0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CD248Q9HCU0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD248Q9HCU0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD248Q9HCU0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD248Q9HCU0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD248Q9HCU0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD248Q9HCU0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CD248Q9HCU0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD248Q9HCU0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD248Q9HCU0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD248Q9HCU0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CD248Q9HCU0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD248Q9HCU0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CD248Q9HCU0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CD248Q9HCU0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD248Q9HCU0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD248Q9HCU0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD248Q9HCU0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD248Q9HCU0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD248Q9HCU0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD248Q9HCU0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD248Q9HCU0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms