Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIAA1549Q9HCM3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KIAA1549Q9HCM3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms