Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VAT1LQ9HCJ6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VAT1LQ9HCJ6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
VAT1LQ9HCJ6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms