Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LY9Q9HBG7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LY9Q9HBG7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LY9Q9HBG7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LY9Q9HBG7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LY9Q9HBG7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LY9Q9HBG7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LY9Q9HBG7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LY9Q9HBG7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LY9Q9HBG7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LY9Q9HBG7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LY9Q9HBG7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LY9Q9HBG7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LY9Q9HBG7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LY9Q9HBG7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LY9Q9HBG7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LY9Q9HBG7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LY9Q9HBG7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LY9Q9HBG7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LY9Q9HBG7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LY9Q9HBG7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LY9Q9HBG7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LY9Q9HBG7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LY9Q9HBG7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LY9Q9HBG7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LY9Q9HBG7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LY9Q9HBG7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LY9Q9HBG7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LY9Q9HBG7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LY9Q9HBG7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LY9Q9HBG7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LY9Q9HBG7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LY9Q9HBG7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LY9Q9HBG7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LY9Q9HBG7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LY9Q9HBG7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LY9Q9HBG7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LY9Q9HBG7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LY9Q9HBG7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LY9Q9HBG7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LY9Q9HBG7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LY9Q9HBG7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LY9Q9HBG7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LY9Q9HBG7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LY9Q9HBG7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms