Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EBF2Q9HAK2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EBF2Q9HAK2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EBF2Q9HAK2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms