Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COG4Q9H9E3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG4Q9H9E3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG4Q9H9E3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG4Q9H9E3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG4Q9H9E3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG4Q9H9E3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG4Q9H9E3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG4Q9H9E3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COG4Q9H9E3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG4Q9H9E3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG4Q9H9E3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG4Q9H9E3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COG4Q9H9E3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG4Q9H9E3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG4Q9H9E3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG4Q9H9E3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG4Q9H9E3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG4Q9H9E3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG4Q9H9E3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG4Q9H9E3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG4Q9H9E3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms