Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y7

RNF167, E3 ubiquitin-protein ligase RNF167, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF167Q9H6Y7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF167Q9H6Y7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF167Q9H6Y7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms