Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC86Q9H6F5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC86Q9H6F5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms