Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E9

BRD8, Bromodomain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD8Q9H0E9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRD8Q9H0E9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BRD8Q9H0E9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRD8Q9H0E9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRD8Q9H0E9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRD8Q9H0E9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRD8Q9H0E9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD8Q9H0E9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD8Q9H0E9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD8Q9H0E9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD8Q9H0E9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD8Q9H0E9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD8Q9H0E9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD8Q9H0E9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD8Q9H0E9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD8Q9H0E9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD8Q9H0E9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD8Q9H0E9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD8Q9H0E9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD8Q9H0E9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD8Q9H0E9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD8Q9H0E9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD8Q9H0E9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD8Q9H0E9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD8Q9H0E9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD8Q9H0E9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD8Q9H0E9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD8Q9H0E9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD8Q9H0E9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
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