Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YIPF3Q9GZM5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms