Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT23Q9C075 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT23Q9C075 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT23Q9C075 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT23Q9C075 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT23Q9C075 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms