Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM15Q9C019 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM15Q9C019 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM15Q9C019 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms