Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR2

KRTAP4-5, Keratin-associated protein 4-5, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-5Q9BYR2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRTAP4-5Q9BYR2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP4-5Q9BYR2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP4-5Q9BYR2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP4-5Q9BYR2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP4-5Q9BYR2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP4-5Q9BYR2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP4-5Q9BYR2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP4-5Q9BYR2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP4-5Q9BYR2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP4-5Q9BYR2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP4-5Q9BYR2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP4-5Q9BYR2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP4-5Q9BYR2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP4-5Q9BYR2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP4-5Q9BYR2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP4-5Q9BYR2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP4-5Q9BYR2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP4-5Q9BYR2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP4-5Q9BYR2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP4-5Q9BYR2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP4-5Q9BYR2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP4-5Q9BYR2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP4-5Q9BYR2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP4-5Q9BYR2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP4-5Q9BYR2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP4-5Q9BYR2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP4-5Q9BYR2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP4-5Q9BYR2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP4-5Q9BYR2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms