Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC8Q9BY41 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.8 ms